CAGE-seq
・各遺伝子を転写開始点ごとに定量:世界で唯一、ゲノムワイドにプロモーター活性を定量解析できる技術 ・定量性に優れる:PCRの工程が無く、5’末端に特化してシークエンスするため、RNA-seqのように長さのバイアスも無く、定量性に優れる ・高感度:200万のRNA分子から1つのRNAを99.99%の確度で検出可能 ・新規RNA分子(mRNA、lncRNAやエンハンサーRNAなどのncRNA)・プロモーターを発見できる可能性もある ・転写因子結合モチーフ探索:発現変動が確認された転写開始点周辺情報を基に、モチーフ配列を探索することで、関与していた可能性のある転写因子を予測することができます ・大規模、かつ、高速の解析が低コストで実現可能 ・理研とダナフォームが共同開発した技術