探している技術や疑問、お問合せするほどでもないのだけど「ちょっと聞きたい」ことにもお答えします。 （質問内容は委託ナビに送信されます）
神奈川県横浜市鶴見区末広町1-1-43 ライフサイエンス研究センター402号
RNA-seq
MA-plot, デンドログラム, ヒートマップ, 遺伝子オントロジー, Fastqファイル, カウント一覧・FPKM一覧, BAMファイル, BedGraphファイル等
サンプル条件
Total RNA量：推奨1 µg（ヒト・マウス・ラットは10 ngでも可能）
RIN（RNA分解指標）：＞7.0（ヒト・マウス・ラットは≧3.0でも可能）
純度：A260/A280、A260/A230共に1.8以上
濃度：＞1 ng/µL
溶媒：RNAフリー水
次世代シーケンサーを用いた発現解析の手法のひとつです。サンプル中のRNA分子を網羅的に読み取るトランスクリプトーム法であり、最近の遺伝子研究にとって欠かせない存在になっています。
私たち生き物の体内では、DNAからRNAが転写されアミノ酸に翻訳される、セントラルドグマと呼ばれる現象が日々起こっています。組織の違いや病態の違いなどを知るための手法として、転写産物であるRNA分子を網羅的に読み取り、 そのシーケンスリードの本数を数えることで発現情報を得ます。データベース上のリファレンスゲノム情報を利用したり、 リファレンス情報の無い生物種でもインフォマティクス解析を追加したりすることで、遺伝子名や発現量を知ることができます。
・抽出したRNAを送るだけ！
・組織や細胞を送るだけ！便利なRNA抽出オプションもあります。
・インフォマティクス解析・RNA品質チェックの費用も含み、トータルでお求めやすい価格です。
・約3週間の短納期！（50+25 bp ペアエンド仕様の場合）
・モデル生物から非モデル生物まで、ヒト・マウスをはじめ、動物・植物・昆虫・酵母・細菌など、多岐にわたる生物種の解析実績があります。
・RNA量や目的に応じてライブラリー作製キット・シーケンス仕様を用意。幅広いご要望に対応可能です。
・生物種に応じたリボソームRNA除去や、血液サンプル用のグロビンRNA除去のオプションも！
・リファレンス情報のない生物種には、解析オプションde novoアセンブリを追加し対応。
RNA-seq解析実績の説明
バイオ事業の専門企業として高い研究と良質な技術を持った頭脳集団となり、理研ベンチャーから世界に役立つ企業として「お客様」「株主」「従業員」が共に満足する企業を目指しております。
| ホームページ | http://www.dnaform.jp/ |
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・各遺伝子を転写開始点ごとに定量：世界で唯一、ゲノムワイドにプロモーター活性を定量解析できる技術 ・定量性に優れる：PCRの工程が無く、5’末端に特化してシークエンスするため、RNA-seqのように長さのバイアスも無く、定量性に優れる ・高感度：200万のRNA分子から１つのRNAを99.99%の確度で検出可能 ・新規RNA分子（mRNA、lncRNAやエンハンサーRNAなどのncRNA）・プロモーターを発見できる可能性もある ・転写因子結合モチーフ探索：発現変動が確認された転写開始点周辺情報を基に、モチーフ配列を探索することで、関与していた可能性のある転写因子を予測することができます ・大規模、かつ、高速の解析が低コストで実現可能 ・理研とダナフォームが共同開発した技術
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